Cell2SentenceAtvirojo rėžiamojo įtaiso, kuris apie vienaskelės genų ekspresijos rodiklius sujūsime „kelionėms“ kad mažųjų anglies molėjų mąsto analizė ir biologinis skaistymas

Cell2Sentečiai yra atviraskaito kūrinys, kuris keičia vienspalvių genų ekspresijos duomenis į 'kelionės apie sąrašą' analizei ir išvadų generavimui didelės kalbos modelio (LLM) pagrindu. Jis svarsto keitimo tvarkymo prieigą eksprezijos vektorius į sąrašą užrašų, kuriuose yra pertrauktos genų pavadinimai, surikiuoti pagal didėjusią ekspresiją. Tai leidžia LLMs modeliuoti natūralios kalbos pagrindu vienosėlius RNA sekvančių (scRNA-seq) duomenis. Šio kūrinio sudėtyje yra C2S-Scale modeliai, kuri kerta transkriptomikos ir tekstualių duomenų sritis ir leidžia papildomus vienspalvių uždavinius, pvz., perturbacijų prognozavimo, duomenų santraukų, klasterių aprašymo bei biologinio klausimo šaldymo. C2S-Scale modeliai prieinami Hugging Face ir yra paremti architektūra, pvz., Pythia ir Gemma-2. Cell2Sentečiai yra skirtas mokslovei ir mokslininkams, dirbantiems vienosėlių transkriptomikoje. Šioje sistema buvo atnaujinta, pridėjo naujas modelius ir funkcijas, kaip, pavyzdžiui, rizikingos naudojimo patvirtinimas ant specializuotų užtrūkščio formuotės šablono ir multiplovės užtrūkščio formuotės formavimo funkciją. Taip pat ji apima Pythia modelio komplektą užtrūkščio tipų prognoze, užtrūkščio tipų sąlygotoji generacija bei platią multiplovės užtrūkščio-tipų kompleksų modelį, kuris buvo treniruotas virš 57 milijonų humanistinių ir myšių požeminių šūkų pavyzdžio. Cell2Sentence sistema dokumentuota ir turi turorius naudoti, užėjantis pavyzdžius fine-tuning ir įvairių cellų formatavimą iš anksto. Cell2Sentence kūrimas susijęs su van Dijk laboratorija bei jau buvo publikuotas bioRxiv žurnalui priešprintuose. Cell2Sentence leidžia kartą užbaigtą vienviečių celulės atradimą naudodama LLM.